1. Pengaruh lingkungan. Lingkungan berpengaruh besar terhadap timbulnya keanekaragaman, contoh tumbuhan yang kena sinar matahari langsung dengan tumbuhan yang tidak kena sinar matahari langsung akan nampak perbedaannya, diantaranya yang jelas terlihat adalah warna hijau pada daun, perhatikan daun tanaman kupin gajah mana yang mempunyai warna daun yang lebih tua yang kena sinar matahari langsung atau tidak? Jawabnya, yang tidak kena sinar matahari langsung mempunyai warna hijau yang lebih tua.
2. Faktor sifat menurun yang dimiliki oleh makhluk hidup tersebut. Penurunan sifat menurun terhadap generasi selanjutnya terjadi melalui peristiwa perkembangbiakan (reproduksi).
Tidak semua hewan dapat hidup di sembarang tempat yang mempunyai kedalaman air dan pada hewan tertentu saja yang dapat hidup di dalam air yang mempunyai batas-batas kedalaman tertentu. Sedangkan hewan yang biasa hidup dekat permukaan tidak dapat turun lebih dalam lagi. Pada umumnya hewan air yang mempunyai alat yang disebut gurat sisi, yaitu sebuah alat indera yang dimanfaatkan untuk mengetahui kedalaman air (tekanan air).
Contoh penyesuaian hidup pada kedalaman air adalah:
a. Tanaman terapung, dapat hidup dan melakat atau menanamkan akarnya di dasar perairan. Misalnya bunga teratai dan enceng gondok.
b. Hewan yang dapat hidup di bagian laut terdalam, hewan tersebut juga dapat hidup dalam keadaan gelap dan dingin sebab bisa membuat cahaya sendiri di dalam tubuhnya.
